為加強林草種質資源保護和利用，國家林草種質資源設施保存庫新疆分庫已建立了兩個長期庫和一個中期庫，預計可存儲種子8萬份，保存期達百年或更久。目前，新疆分庫首次順利完成500份種子入庫保存工作。
本次入庫的種子主要收集于昌吉州、伊犁州、吐魯番市、博州等地區，每一份種質資源從收集到入庫需要經過2遍清理和檢測。收集時，要詳細記錄生境、位置、土壤、種子狀態等各種信息，采集回來后要進行接收登記，檢查種子、標本、dna材料是否一一對應，如有錯誤，需及時進行標注和處理。接收后放入初步干燥間（溫度15℃，濕度15%）進行干燥，一個月后進行清選工作，凈度要達到98%以上，然后進行千粒重和x光檢測，通過千粒重估算種子重量和數量，通過x光檢測判斷種子質量的好壞，比如蟲蛀數、飽滿數、半飽滿數等。做完數量和質量檢測完成后轉入雙十五間，再干燥一個月后進行含水量測定，水分含量合格后（水活度達到18%以下），才會裝瓶入庫。
2022年，新疆分庫計劃對新疆準噶爾盆地、天山、阿勒泰山等地種質資源進行分區采集。重點收集國家和自治區的保護物種、珍稀瀕危物種、優良牧草及具有中藥藥用價值的種質資源。接下來，種質資源中心計劃在4月到6月對南北疆早春短命植物和榆科匯集圃種質資源進行種質收集。7月到9月對阿勒泰地區和塔城地區林草種質資源進行采集。10月到11月對巴州地區和喀什地區林草種質資源進行收集。